Разработан новый метод анализа генетического перемешивания популяций

Российские биоинформатики совместно с иностранными коллегами разработали новый статистический метод анализа перемешивания популяций. Он позволяет точнее определять время и количество волн миграций.

Зачем это нужно изучать?

В первую очередь это помогает исследовать историю и ответить на следующие вопросы:
— Где жили наши предки?
— Куда и когда они мигрировали?
— Когда и с кем перемешивались?

Всю историю перемешивания популяций можно восстановить, исследуя гены человека. Ранее учёные могли узнать только время последнего перемешивания популяций.

Геном человека представляет собой мозаику из генетических фрагментов предков: мамы и папы, бабушек и дедушек и прочих родственников, живших в разные эпохи. В свою очередь мы передаём детям уже новые сочетания генетических вариантов, мозаику, которая досталась нам от наших родителей. Это явление называют рекомбинацией.

С каждой передачей генов от поколения к поколению рекомбинации всё сильнее перемешивают участки разного происхождения и разбивают характерные генетические последовательности. Со временем они полностью смешиваются.

До недавнего времени учёные могли анализировать силу связей между парой вариантов генов, что помогало лишь определить, сколько прошло поколений с момента перемешивания популяций.

Метод, предложенный учёными из Международной лаборатории статистической и вычислительной геномики НИУ ВШЭ Владимиром Щуром и Михаилом Шишкиным, заключается в анализе тройки генетических вариантов вместо пары. Это позволяет моделировать более сложные сценарии перемешивания популяций.

Представьте, что к берегам Америки приплыли европейцы.

Они начали осваивать территории и перемешиваться с коренным населением. А 70 лет спустя на материк прибыла вторая волна колонизаторов. Потомки первых переселенцев и местных жителей снова смешивались с прибывшими. Новый метод позволяет увидеть эти две волны миграции и два эпизода перемешивания, которые произошли в разное время.

В работе российских учёных и их зарубежных коллег были проанализированы генетические образцы популяции колумбийцев и мексиканцев, собранные в рамках проекта по созданию базы данных 1000 Genomes. Это проект, который хранит данные 1000 генов в открытом доступе, чтобы учёные со всего мира могли использовать их в своих исследованиях.

Популяции народов Северной и Южной Америки появились в результате перемешивания коренных американцев, испанцев и африканцев. Исследование генома позволило учёным узнать, что в истории обеих популяций было по две волны перемешивания. Также удалось выяснить, сколько поколений назад происходили перемешивания генома во время каждой волны. Учёные считают, что их открытие даст расширенное представление об изменениях культуры, традиций и генофонда народов мира.

@obyasnayemrf

---

Читайте также

Специалисты центров «Семья» Саратовской области поделятся уникальным опытом работы на Всероссийском форуме «Вместе – ради детей!»

Подписывайтесь на Светлые вести в Telegram. Самые важные новости - весь день на ваш смартфон